Desde 1978 hasta 2003 el INPC, cumplió sus funciones a nivel nacional a través de las oficinas: Matriz en Quito y tres Direcciones Regionales, la del Litoral en Guayaquil, la del Austro en Cuenca y la de Loja.

Para dar cumplimiento a la Ley de Desconcentración y fortalecer la gestión del patrimonio cultural, entre los años 2008 y 2009 se crearon dos nuevas Direcciones Regionales: en Portoviejo y Riobamba. La primera tiene jurisdicción de las provincias de Manabí y Santo Domingo de los Tsachilas y la segunda, las provincias de Chimborazo, Tungurahua Cotopaxi y Pastaza. Al momento las 5 regionales manejan sus propios presupuestos y asumen en sus territorios las competencias que por ley les corresponde. Las zonas 1 y 2 se articulan desde la ciudad de Quito.

Zona 1: Esmeraldas, Carchi, Imbabura y Sucumbíos // Sede: Quito
INPC Principal (Quito)
Colón Oe-1-93 y Av. 10 de Agosto “La Circasiana”
Telefax: (+593) (2) 2227 927 /2549

Zona 2: Pichincha, Napo y Orellana // Sede: Quito
INPC Principal (Quito)
Colón Oe-1-93 y Av. 10 de Agosto “La Circasiana”
Telefax: (+593) (2) 2227 927 /2549

Zona 3: Pastaza, Cotopaxi, Tungurahua y Chimborazo // Sede: Riobamba
INPC Riobamba
Calle Espejo s/n y Orozco, Edif. La Curia
Telefax: (+593) (3) 2950 597

Zona 4: Manabí, Santo Domingo de los Tsáchilas y Galápagos // Sede: Portoviejo
INPC Portoviejo
Sucre 405 entre Morales y Rocafuerte
Telf: (+593) (0)99755869

Zona 5: Guayas, Los Ríos, Península de Santa Elena y Bolívar // Sede: Guayaquil
INPC Litoral
Calle Numa Ponpilio Llona 182-184, Las Peñas
Telefax (+593) (4) 2303 671

Zona 6: Azuay, Cañar y Morona Santiago // Sede: Cuenca
INPC Cuenca
Benigno Malo No. 640 y Juan Jaramillo
“Casa de las Palomas”
Telf.: (+593) (7) 2833787

Zona 7: El Oro, Loja y Zamora Chinchipe // Sede: Loja
INPC Loja
Av. Orillas del Zamora No. 0592 y Segundo Puertas Moreno
Telf: (+593) (7) 2560 652