Depuis 1978 jusqu'à l'année 2003, l'INPC a assuré ses fonctions dans tout le pays à travers ses différents bureaux : le siège à Quito et ses trois Directions Régionales, celle du Littoral à Guayaquil, celle de Cuenca (sud de l'Équateur) et celle de Loja.

Afin de répondre à la Loi de Décentralisation et de consolider la gestion du patrimoine culturel, deux nouvelles Directions Régionales ont été créées entre 2008 et 2009 : à Portoviejo et Riobamba. La première a à sa charge les provinces de Manabí et Santo Domingo de los Tsachilas et la seconde, celle de Chimborazo, Tungurahua, Cotopaxi et Pastaza. Pour l'instant, les cinq directions régionales gèrent leurs propres budgets et assurent les nouvelles compétences que la loi leur garantit. Les zones 1 et 2 sont administrées depuis la ville de Quito.

Zona 1: Esmeraldas, Carchi, Imbabura y Sucumbíos // Sede: Quito
INPC Principal (Quito)
Colón Oe-1-93 y Av. 10 de Agosto “La Circasiana”
Telefax: (+593) (2) 2227 927 /2549

Zona 2: Pichincha, Napo y Orellana // Sede: Quito
INPC Principal (Quito)
Colón Oe-1-93 y Av. 10 de Agosto “La Circasiana”
Telefax: (+593) (2) 2227 927 /2549

Zona 3: Pastaza, Cotopaxi, Tungurahua y Chimborazo // Sede: Riobamba
INPC Riobamba
Calle Espejo s/n y Orozco, Edif. La Curia
Telefax: (+593) (3) 2950 597

Zona 4: Manabí, Santo Domingo de los Tsáchilas y Galápagos // Sede: Portoviejo
INPC Portoviejo
Sucre 405 entre Morales y Rocafuerte
Telf: (+593) (0)99755869

Zona 5: Guayas, Los Ríos, Península de Santa Elena y Bolívar // Sede: Guayaquil
INPC Litoral
Calle Numa Ponpilio Llona 182-184, Las Peñas
Telefax (+593) (4) 2303 671

Zona 6: Azuay, Cañar y Morona Santiago // Sede: Cuenca
INPC Cuenca
Benigno Malo No. 640 y Juan Jaramillo
“Casa de las Palomas”
Telf.: (+593) (7) 2833787

Zona 7: El Oro, Loja y Zamora Chinchipe // Sede: Loja
INPC Loja
Av. Orillas del Zamora No. 0592 y Segundo Puertas Moreno
Telf: (+593) (7) 2560 652